Les meilleurs logiciels de facturation électronique agréés en 2026

1. Deux conformités à ne pas confondre

Quand on parle de logiciel de facturation « agréé », deux réglementations différentes se cachent derrière le mot. Les confondre, c'est risquer de choisir un outil conforme à l'une mais pas à l'autre.

• La loi anti-fraude TVA (depuis 2018) : l'article 286 bis du Code général des impôts impose que tout logiciel servant à encaisser des particuliers (B2C) soit inaltérable, sécurisé, conservé et archivé. La preuve passe par un certificat (norme NF 525, délivrée par AFNOR Certification) ou une attestation de l'éditeur. Une amende de 7 500€ par logiciel non conforme sanctionne l'absence de preuve.
• La réforme de la facturation électronique (2026-2027) : issue de l'ordonnance n° 2021-1190 et confirmée par les lois de finances successives, elle impose d'émettre et recevoir les factures B2B au format électronique structuré, via une Plateforme Agréée ou le Portail Public de Facturation (PPF), avec transmission des données à l'administration (e-reporting).

2. Le calendrier de la réforme 2026-2027

Deux obligations distinctes, deux logiques de déploiement. La réception concerne tout le monde à la même date. L'émission arrive par paliers selon la taille de l'entreprise.

Calendrier en vigueur à la date de mise à jour. La réforme a déjà été reportée plusieurs fois depuis 2022 : vérifiez la version officielle sur impots.gouv.fr avant de planifier.

La conséquence pratique : même une micro-entreprise devra recevoir ses factures au format électronique dès septembre 2026. Choisir un logiciel déjà raccordé en tant que PDP, ou interopérable avec le PPF, évite une migration en urgence à l'été 2027.

3. Notre classement des logiciels de facturation conformes

Vingt-deux solutions cochent les cases de la conformité. Nous les avons classées en commençant par celles qui sont les plus en avance sur la réforme e-facture (statut Plateforme Agréée confirmé), puis par profil d'usage. Pour chacune : le statut Plateforme Agréée (ex-PDP), le positionnement, le tarif d'entrée et la limite à connaître.

1. Indy : facturation gratuite et statut PDP pour les indépendants

Indy est un logiciel de comptabilité et de facturation pour indépendants, doté d'une formule de facturation gratuite et du statut de Plateforme de Dématérialisation Partenaire. C'est l'un des outils les plus adaptés aux freelances qui veulent être conformes à la réforme sans surcoût.

• Statut e-facture : PDP agréée, réception et émission gérées nativement
• Positionnement : compta automatisée, facturation et compte pro pour indépendants
• Tarif : facturation gratuite, déclarations dès 9€ HT/mois en formule Plus
• Limite : ce n'est pas un expert-comptable inscrit à l'Ordre, pas de gestion de paie ni d'intégrations tierces (Stripe, Shopify)

Essayer Indy (formule gratuite)

2. Tiime : PDP immatriculée et compte pro intégré

Tiime fait partie des solutions françaises disposant du statut de Plateforme de Dématérialisation Partenaire. Adoptée par 300 000 entrepreneurs, elle combine facturation électronique, compte pro Mastercard, notes de frais et collaboration avec un réseau de 3 000 cabinets partenaires.

• Statut e-facture : PDP agréée, réception des factures électroniques gérée nativement
• Positionnement : plateforme tout-en-1 facturation + compte pro pour freelances et TPE
• Tarif : facturation gratuite (offre Free), compte pro et tableaux de bord dès 17,99€ HT/mois (Smart), prévisionnel et API dès 24,99€ HT/mois (Business)
• Limite : pas de gestion des SCI ni des holdings, expertise comptable via un cabinet partenaire

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3. Pennylane : la référence des experts-comptables

Pennylane est le logiciel de gestion et de comptabilité le plus adopté par les cabinets d'expertise comptable et leurs clients TPE/PME. La plateforme réunit facturation, comptabilité et trésorerie en temps réel, et figure parmi les éditeurs immatriculés comme PDP.

• Statut e-facture : PDP, prêt pour l'émission et la réception au format structuré
• Positionnement : plateforme collaborative pilotée avec votre expert-comptable, plus de 120 intégrations, Compte Pro accessible dès le plan Starter à 7€ HT/mois
• Tarif : offre gratuite réservée aux micro-entreprises (1 utilisateur, jusqu'à 1 200 factures par an, édition et réception de factures conformes), puis dès 7€ HT/mois en logiciel seul, intégré au forfait du cabinet partenaire sinon
• Limite : Pennylane est un logiciel, pas un cabinet inscrit à l'Ordre ; ne gère ni SCI ni holding en natif

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4. Qonto : compte pro et facturation gratuite immatriculée

Qonto est la néobanque pro la plus utilisée en France et figure parmi les Plateformes Agréées immatriculées par la DGFiP. Son outil de facturation est inclus dans le compte pro : devis, factures, relances et réception des factures électroniques se gèrent au même endroit que les paiements et la pré-comptabilité.

• Statut e-facture : Plateforme Agréée immatriculée, émission et réception au format structuré
• Positionnement : compte pro + facturation + pré-compta, nombreuses intégrations (dont logiciels comptables)
• Tarif : facturation incluse, compte pro dès 9€ HT/mois
• Limite : ce n'est ni un logiciel de comptabilité complet, ni un expert-comptable ; la tenue comptable passe par un outil ou un cabinet tiers

5. Sage : la solution des PME établies, Plateforme Agréée

Sage est un éditeur reconnu des experts-comptables français et figure parmi les Plateformes Agréées immatriculées. Sa gamme combine la puissance d'un logiciel de gestion avec la flexibilité du cloud, et intègre la conformité à la loi anti-fraude.

• Statut e-facture : Plateforme Agréée immatriculée (vérifiez l'activation selon votre produit Sage)
• Conformité loi 2018 : attestation éditeur, piste d'audit complète
• Positionnement : facturation et comptabilité intégrées, multi-utilisateurs, gestion commerciale
• Tarif : dès 39€ HT/mois
• Limite : mieux adapté aux PME qu'aux freelances, prise en main moins immédiate

6. Sellsy : CRM, facturation et trésorerie pour le B2B

Sellsy est une solution française qui réunit CRM, facturation et gestion de trésorerie, et fait partie des Plateformes Agréées immatriculées. Son approche tout-en-un parle aux équipes commerciales qui veulent piloter le cycle de vente jusqu'à l'encaissement depuis un seul outil.

• Statut e-facture : Plateforme Agréée immatriculée, émission et réception au format structuré
• Conformité loi 2018 : attestation éditeur, données sécurisées et archivées
• Positionnement : CRM intégré, trésorerie prévisionnelle, portail client, catalogue produits
• Tarif : dès 45€ HT/mois
• Limite : comptabilité partielle, plus orienté pilotage commercial que tenue comptable complète

7. EBP : la valeur sûre des artisans et TPE

EBP est l'un des éditeurs français les plus implantés chez les artisans, commerçants et TPE. Ses logiciels sont certifiés NF 525 et accompagnés d'une attestation individuelle conforme à la loi anti-fraude 2018. EBP ne figure pas en nom propre sur la liste des Plateformes Agréées, mais depuis son rachat par le groupe Cegid en juillet 2024, la PA Cegid est intégrée directement dans les logiciels EBP, sans module additionnel ni surcoût. La conformité e-facture est donc assurée par la maison mère.

• Statut e-facture : non immatriculée en nom propre ; les factures transitent par la Plateforme Agréée Cegid, éditeur propriétaire d'EBP
• Conformité loi 2018 : certification NF 525, la norme la plus reconnue de l'administration française
• Positionnement : facturation, devis, gestion commerciale en desktop ou cloud, export comptable
• Tarif : à partir de 26,25€ HT/mois pour la gestion commerciale en SaaS (offre Hubbix), 37,50€ en ACTIV, 63,75€ en PRO
• Limite : ergonomie plus classique que les pure players cloud récents, et dépendance à la PA du groupe plutôt qu'à une immatriculation propre

8. jefacture.com : la Plateforme Agréée portée par l'Ordre

jefacture.com est éditée par ECMA, une association loi 1901 créée à l'initiative du Conseil National de l'Ordre des Experts-Comptables. C'est la seule Plateforme Agréée du marché portée par la profession comptable elle-même, et l'une des rares à publier une grille tarifaire complète, palier par palier.

• Statut e-facture : Plateforme Agréée immatriculée en décembre 2025, connecteurs Peppol, Chorus Pro et e-mail
• Positionnement : facturation et collaboration avec votre expert-comptable, sans tenue comptable
• Tarif : offre Freemium gratuite limitée à 5 factures par mois, puis 5€ HT/mois pour 20 factures, 17€ pour 100, 140€ pour 1 000. L'offre Optimum ajoute un compte pro et le paiement, dès 13€ HT/mois
• Limite : ne fait que la facturation, et le rapprochement bancaire est réservé à l'offre Optimum

9. macompta.fr : le meilleur prix d'entrée

macompta.fr vend sa comptabilité en ligne par modules, avec des tarifs publiés au centime près. C'est le tarif d'entrée le plus bas parmi les Plateformes Agréées qui gèrent aussi la tenue comptable, à condition d'avoir des bases en comptabilité.

• Statut e-facture : Plateforme Agréée immatriculée en janvier 2026
• Positionnement : comptabilité, facturation, immobilisations, déclarations fiscales et paie, activables séparément
• Tarif : 7,04€ HT/mois pour la comptabilité simplifiée, 15,40€ pour la complète, 8,80€ pour la facturation, dès 24,92€ pour la paie
• Point fort rare : accès gratuit pour votre expert-comptable, et plans comptables association et agricole gérés correctement
• Limite : interface datée, et il faut savoir tenir une comptabilité pour en tirer quelque chose

10. MyUnisoft : l'outil des cabinets comptables

MyUnisoft a été créée en 2018 par quatre cabinets d'expertise comptable qui voulaient leur propre outil de production. Plus de 1 000 cabinets français travaillent dessus. Ce n'est pas un logiciel qu'un dirigeant achète seul : c'est celui sur lequel votre expert-comptable tient votre dossier.

• Statut e-facture : Plateforme Agréée immatriculée en avril 2026, Factur-X natif sans paramétrage
• Positionnement : production comptable pour le cabinet, espace client et gestion commerciale pour l'entreprise
• Tarif : offre MyU Gestion First gratuite côté entreprise ; offre cabinet au dossier, sur devis, sans grille publique
• Limite : aucune transparence tarifaire, et la solution n'a d'intérêt que si votre cabinet l'a adoptée

11. Obat : la référence des artisans du BTP

Obat est un logiciel de devis et facturation conçu pour les artisans et les entreprises du bâtiment, avec la gestion des chantiers et des situations de travaux. L'éditeur revendique plus de 31 000 artisans utilisateurs. La conformité e-facture passe par Iopole, Plateforme Agréée partenaire.

• Statut e-facture : non immatriculée en nom propre ; émission au format Factur-X et réception via la PA partenaire Iopole
• Positionnement : devis, factures, situations de travaux, suivi de chantier et bibliothèque de prix BTP
• Tarif : à partir de 24€ HT/mois en formule Starter, jusqu'à environ 109€ HT/mois en formule complète, essai gratuit de 15 jours
• Limite : pas de tenue comptable, et la dépendance à une PA partenaire plutôt qu'à une immatriculation propre

Artisan ou entreprise du bâtiment ? Notre page dédiée à l'expert-comptable BTP détaille les spécificités comptables du secteur, de la TVA à 10 % à l'autoliquidation en sous-traitance.

12 à 22. Les autres solutions conformes

Onze autres solutions complètent la sélection. Nous distinguons celles qui sont immatriculées Plateforme Agréée (e-facture gérée en propre) de celles qui restent des logiciels de facturation non immatriculés : ces derniers sont utilisables, mais s'appuieront sur le PPF ou sur une PA partenaire pour transmettre vos factures.

Plateformes Agréées immatriculées :

• Cegid Loop : solution d'un éditeur français de référence pour PME, ETI et experts-comptables, Plateforme Agréée immatriculée, conformité native, tarif sur devis.
• Axonaut : ERP français tout-en-un (CRM, facturation, projet, RH) pour TPE de services, Plateforme Agréée immatriculée, dès 97€ HT/mois tout inclus (par utilisateur), données hébergées en France.
• Abby : appli de facturation et de gestion pensée pour les auto-entrepreneurs, Plateforme Agréée immatriculée, formule gratuite puis premium, déclarations Urssaf intégrées.
• Esker : Plateforme Agréée immatriculée orientée moyennes et grandes entreprises (dématérialisation des achats et des ventes, P2P/O2C), tarif sur devis.
• Iopole : Plateforme Agréée immatriculée souvent intégrée par les experts-comptables et éditeurs comme « moteur » e-facture, plus que comme logiciel de facturation grand public.
• Yooz : Plateforme Agréée immatriculée spécialiste de la dématérialisation et de l'automatisation des factures fournisseurs (P2P) pour PME et ETI, tarif sur devis.

Logiciels de facturation non immatriculés (via PPF ou PA partenaire) :

• Evoliz : logiciel de facturation français 100% en ligne (groupe Visma), simple et certifié NF, dès 29€ HT/mois (≈14,50€ en annuel) ; raccordement e-facture inclus via Chaintrust, la PA du groupe.
• QuickBooks : logiciel international d'Intuit adapté à la France, attestation loi 2018, dès 12€ HT/mois, fort sur le multi-devises ; e-facture via une PA partenaire.
• Sinao : logiciel de facturation et de gestion 100% français pour indépendants et TPE, dès 9€ HT/mois, export FEC pour votre expert-comptable.
• Henrri : logiciel de facturation gratuit (groupe Rivalis) pour freelances et TPE, simple et conforme loi 2018 ; e-facture via une PA partenaire.
• Freebe : outil de facturation et de suivi d'activité dédié aux freelances et micro-entrepreneurs, dès ~6€ HT/mois ; e-facture via une PA partenaire.

Un logiciel non immatriculé Plateforme Agréée n'est pas pour autant « non conforme » : il transmet vos factures via la PA d'un partenaire. En revanche, le repli vers un service public gratuit n'existe plus depuis que le PPF a abandonné l'échange de factures en octobre 2024. Demandez à votre éditeur le nom de la Plateforme Agréée sur laquelle il s'adosse, et ce qu'elle coûte, avant le 1er septembre 2026.

4. Tableau comparatif

Immatriculée Plateforme Agréée inscrite sur la liste officielle DGFiP  ·  Non immatriculée logiciel de facturation conforme qui s'adosse à la Plateforme Agréée d'un partenaire pour transmettre vos factures.

Tarifs indicatifs 2026 hors promotions, en HT. Le statut Plateforme Agréée (ex-PDP) évolue vite : la liste officielle des plateformes immatriculées est publiée et mise à jour sur impots.gouv.fr (146 plateformes au 16 août 2026). Vérifiez-la avant tout engagement. Le détail des grilles tarifaires figure dans notre guide combien coûte une plateforme agréée.

5. Comment choisir selon votre profil

Le bon logiciel dépend de votre statut, de votre volume de factures et de la présence ou non d'un expert-comptable. Raisonnez par profil plutôt que par classement absolu.

• Freelance ou micro-entrepreneur : visez la gratuité et le statut PDP. Indy et Tiime couvrent la facturation gratuitement et gèrent déjà l'e-facture. Pennylane propose désormais lui aussi une offre gratuite réservée aux micro-entreprises (1 utilisateur, jusqu'à 1 200 factures par an) qui couvre l'édition et la réception de factures conformes. Pour aller plus loin sans frais, voyez aussi notre comparatif des logiciels de comptabilité gratuits.
• TPE avec un expert-comptable : Pennylane simplifie la collaboration, car de nombreux cabinets travaillent nativement dessus. Si votre cabinet est déjà équipé, il vous orientera vers son propre outil : MyUnisoft ou jefacture.com sont les deux plus répandus dans la profession.
• TPE en autonomie, budget serré : macompta.fr à 7,04€ HT/mois est le tarif d'entrée le plus bas parmi les Plateformes Agréées qui gèrent aussi la tenue. À condition de savoir tenir une comptabilité.
• Artisan, commerçant, BTP (encaissements B2C) : la conformité loi 2018 prime. EBP (NF 525) ou une solution de caisse certifiée restent des valeurs sûres. Pour le bâtiment spécifiquement, Obat gère les situations de travaux que les outils généralistes ignorent : voir notre page expert-comptable BTP.
• PME avec volume et gestion commerciale : Sage, Cegid Loop ou Sellsy selon que vous priorisez la comptabilité ou le CRM. Pensez au compte pro adapté dans notre comparatif des meilleurs comptes pro.

6. Vérifier la conformité avant de signer

Avant tout engagement ou contrôle fiscal, assurez-vous de pouvoir prouver les deux conformités. Voici la checklist.

• Demandez l'attestation loi 2018 : tout éditeur conforme la fournit sur simple demande. S'il ne peut pas, changez de logiciel. Conservez-la tant que vous utilisez l'outil et 6 ans après.
• Vérifiez la certification NF 525 : délivrée par AFNOR Certification, c'est la preuve la plus solide pour les logiciels de caisse. La liste des produits certifiés est publiée par l'AFNOR.
• Contrôlez le statut PDP : consultez la liste officielle des Plateformes de Dématérialisation Partenaire immatriculées sur impots.gouv.fr, ou notre récapitulatif pour consulter les plateformes agréées immatriculées. Une promesse marketing « bientôt conforme » ne vaut pas une immatriculation effective.
• Vérifiez les formats supportés : Factur-X, UBL et CII sont les formats structurés attendus. Un logiciel qui ne génère que des PDF non structurés ne sera pas conforme à l'émission.

7. Questions fréquentes