Expert-comptable pour kinésithérapeute : comptabilité kiné, 2035 et coûts en 2026

1. Micro-BNC ou réel : un choix qui se pose vite pour un kiné

Les honoraires d'un masseur-kinésithérapeute libéral sont des bénéfices non commerciaux. Le micro-BNC s'applique tant que les recettes de l'année précédente ou de l'avant-dernière ne dépassent pas 83 600 € en 2026 (article 102 ter du CGI), avec un abattement forfaitaire de 34 %. Au-delà de ce seuil deux années consécutives, la déclaration contrôlée, c'est-à-dire le régime réel, devient obligatoire. Un kiné conventionné ne relève pas du régime micro-entrepreneur : seul le micro-BNC fiscal est ouvert, et ses cotisations restent calculées par l'URSSAF et la CARPIMKO selon les règles des PAMC.

Chez les kinés, le réel est souvent choisi bien avant le seuil, pour trois raisons : le matériel coûte cher, le local pèse lourd et, pour un collaborateur, la redevance versée au titulaire représente une part importante des honoraires. Au réel, tout cela se déduit, de même que les cotisations URSSAF et CARPIMKO. En micro, l'abattement forfaitaire de 34 % couvre l'ensemble des frais et des cotisations, quel que soit leur montant réel.

Exemple : un kiné titulaire encaisse 80 000 € de recettes, sous le seuil. En micro, son bénéfice imposable est de 52 800 € (80 000 x 66 %), soit 27 200 € d'abattement. Au réel, il déduit 12 000 € de loyer, 3 000 € d'amortissement de matériel, 5 000 € de frais divers (assurance RCP, cotisation ordinale, logiciel, téléphone, formation, blanchissage) et environ 13 000 € de cotisations CARPIMKO et de CSG déductible selon notre calcul avec les taux 2026. Total : environ 33 000 €, soit près de 6 000 € de bénéfice imposable en moins qu'en micro. Montants donnés à titre d'illustration.

2. Recettes, aides conventionnelles et TVA

La comptabilité BNC se tient en recettes encaissées. Le livre-journal doit retracer, au jour le jour, chaque encaissement :

• Les paiements de l'Assurance maladie en tiers payant et la part des complémentaires, à rapprocher de vos télétransmissions SESAM-Vitale pour repérer les rejets.
• Les honoraires réglés directement par les patients, y compris les dépassements autorisés.
• Les indemnités de déplacement facturées pour les soins à domicile selon la nomenclature. Ce sont des honoraires, pas des remboursements.
• Les forfaits et aides conventionnels : forfait d'aide à la modernisation et à l'informatisation (FAMI) versé après déclaration de vos indicateurs sur amelipro, aides à l'installation en zone sous-dotée prévues par la convention (contrat d'aide à l'installation, CAIMK). Ce sont des recettes imposables de l'année d'encaissement.

TVA : les soins exonérés, le reste à surveiller

Les soins dispensés par les membres des professions paramédicales réglementées sont exonérés de TVA (article 261, 4-1° du CGI), à condition d'avoir une finalité thérapeutique. Un kiné qui propose des séances de bien-être sans prescription ni visée thérapeutique, du coaching sportif ou qui vend du matériel aux patients réalise des opérations taxables. Elles restent sans TVA tant que les recettes concernées ne dépassent pas les seuils de la franchise en base : 37 500 € pour les services et 85 000 € pour les ventes en 2026.

3. Matériel, local et patientèle : le cœur de la comptabilité kiné

C'est ce qui distingue un kiné d'une infirmière ou d'un psychologue : l'investissement de départ et son renouvellement. Les règles à connaître :

Exemple chiffré : une table électrique achetée 3 000 € HT vous coûte 3 600 € TTC. Amortie sur 5 ans (durée retenue à titre d'exemple), elle génère 720 € de charge par an. Le même raisonnement s'applique à chaque appareil du plateau technique, d'où l'intérêt d'un registre des immobilisations tenu à jour : sans lui, des amortissements sont oubliés et le bénéfice déclaré est trop élevé. Les tenues professionnelles et leur entretien se déduisent aussi ; le lavage à domicile peut être évalué au tarif des blanchisseurs (BOI-BNC-BASE-40-60-30). Pour les principes communs à tous les libéraux, voyez notre guide de la comptabilité des professions libérales.

4. Collaboration, remplacement, SCM, société : exercer à plusieurs

Le kiné collaborateur (assistanat)

Le contrat de collaboration libérale (article 18 de la loi n° 2005-882 du 2 août 2005) permet au collaborateur d'exercer dans le cabinet du titulaire en lui reversant une redevance, souvent calculée en pourcentage des honoraires. Pour le collaborateur, c'est une charge ; pour le titulaire, une recette. Les deux doivent retrouver le même montant dans leurs comptes.

Le remplacement

Le remplaçant exerce à la place du titulaire absent, avec les feuilles de soins du titulaire, alors que le collaborateur facture sous son propre nom et encaisse ses honoraires. Quand le titulaire encaisse les honoraires puis reverse sa part au remplaçant, il déduit les sommes rétrocédées sur la 2035 et les déclare sur la DAS2 au-delà de 2 400 € par an et par bénéficiaire (article 240 du CGI). Le remplaçant les déclare comme ses propres recettes.

Le cabinet de groupe en SCM

La société civile de moyens (article 36 de la loi n° 66-879 du 29 novembre 1966) porte les frais communs : loyer, secrétariat, matériel partagé, salle de rééducation. Elle dépose une déclaration 2036 et chaque associé reprend sa quote-part sur sa propre 2035. Quand la SCM détient du matériel, il faut aussi suivre ses amortissements. C'est là qu'un expert-comptable fait gagner du temps à tout le groupe.

MSP, SISA et société d'exercice

Dans une maison de santé pluriprofessionnelle, une société interprofessionnelle de soins ambulatoires (article L4041-1 du Code de la santé publique) peut percevoir des rémunérations collectives de l'Assurance maladie et les répartir. En société d'exercice libéral (SELARL ou SELAS), on sort de la 2035 : la société est en principe à l'impôt sur les sociétés, avec bilan et liasse fiscale. Un expert-comptable inscrit à l'Ordre est alors la seule option réaliste.

5. URSSAF et CARPIMKO en 2026

Le kiné conventionné relève du régime des praticiens et auxiliaires médicaux conventionnés (PAMC, article L646-1 du Code de la sécurité sociale). L'URSSAF appelle la maladie, les allocations familiales et la CSG-CRDS ; sur les revenus conventionnés, l'Assurance maladie prend en charge l'essentiel de la cotisation maladie. La CARPIMKO appelle la retraite et la prévoyance.

La CARPIMKO résume l'effet de la réforme : la CSG-CRDS baisse, la retraite augmente. Le remboursement que l'URSSAF verse à beaucoup de praticiens en 2026 sert donc, en pratique, à payer la hausse de la CARPIMKO. Pendant les deux premières années d'activité, les cotisations sont calculées sur une base forfaitaire puis régularisées : prévoyez une trésorerie de côté. Les cotisations facultatives de retraite (PER) et de prévoyance (contrats Madelin) se déduisent aussi du bénéfice au réel, dans les limites de l'article 154 bis du CGI.

6. Les déclarations de l'année

La DSFU distingue la part de revenus tirée de l'activité conventionnée : c'est elle qui fixe la participation de l'Assurance maladie et vos cotisations CARPIMKO. Côté CFE, la première année est exonérée (article 1478 du CGI) et une commune peut exonérer pendant deux à cinq ans un auxiliaire médical qui s'installe dans une commune de moins de 2 000 habitants ou dans une zone rurale éligible (article 1464 D du CGI).

7. Indy ou expert-comptable : le coût réel sur un an

Prix d'entrée relevés sur les grilles officielles (Indy le 22/10/2026, cabinets le 29/09/2026). Exonéré de TVA, un kiné paie le prix TTC.

Ces prix concernent la 2035 d'une entreprise individuelle. La 2036 d'une SCM ou la comptabilité d'une SELARL font l'objet de devis séparés. Indy est un logiciel, pas un cabinet d'expertise comptable : la formule Autonomie couvre la 2035 avec sa télétransmission, la DSFU, la CFE, la DAS2, la 2042-C-PRO et la TVA si vous en avez, avec des conseils illimités par chat et par mail, mais c'est vous qui validez vos écritures et votre registre des immobilisations. Indy annonce une garantie fiscale : si l'administration conteste une déclaration à cause d'une erreur d'Indy, Indy indique prendre en charge les pénalités et majorations. La formule Sérénité ajoute un expert-comptable partenaire qui gère et valide vos déclarations, avec 3 heures de rendez-vous par an. Voir notre avis sur Indy et le comparatif Indy ou expert-comptable.

Pour élargir le choix, consultez notre sélection des meilleurs experts-comptables pour professions libérales, le comparatif des logiciels de comptabilité pour libéraux et notre guide du coût d'un expert-comptable pour professionnel de santé.

8. Quelle solution selon votre profil

Vous partagez un cabinet avec d'autres soignants ? Les règles changent selon la profession : voyez nos pages pour l'infirmier libéral, l'ostéopathe, le psychologue et le médecin.

Questions fréquentes