Logiciel de comptabilité pour profession libérale : quel outil pour votre 2035 en 2026 ?

1. Avez-vous vraiment besoin d'un logiciel 2035 ?

La déclaration 2035 n'existe qu'au régime de la déclaration contrôlée. En micro-BNC, vous reportez vos recettes sur la 2042-C-PRO et l'administration retire un abattement forfaitaire de 34 %. Pas de 2035, pas de livre-journal des dépenses, pas d'amortissements : un outil de facturation et un livre des recettes suffisent.

Vous basculez au réel dans deux cas. Soit vos recettes dépassent le plafond du micro, fixé à 83 600 € pour les prestations de services BIC et les BNC en 2026 (il était de 77 700 € auparavant), deux années civiles consécutives : un seul dépassement ne suffit pas. Soit vous optez volontairement pour le réel parce que vos charges dépassent 34 % de vos recettes. Un kinésithérapeute qui loue un cabinet et rembourse un emprunt de matériel, ou un psychologue qui paie un loyer en centre-ville, a souvent intérêt à l'option. Notre guide passer du micro-BNC au réel détaille le calcul et les démarches.

2. Les critères propres au libéral

Un logiciel généraliste pensé pour les SAS tient une comptabilité d'engagement (factures émises, factures reçues). Le libéral, lui, tient par défaut une comptabilité de trésorerie : seules comptent les sommes encaissées et payées dans l'année. L'article 99 du Code général des impôts impose un livre-journal servi au jour le jour, avec le détail des recettes et des dépenses professionnelles, et un document qui retrace les immobilisations et leurs amortissements. Le logiciel doit partir de là, pas d'un plan comptable de société adapté à la va-vite.

Les pièges propres aux professions de santé

Les virements de l'Assurance maladie arrivent groupés : un seul mouvement bancaire regroupe des dizaines d'actes télétransmis. Le logiciel doit les classer en recettes sans que vous ayez à les ventiler une par une, et vous devez pouvoir les rapprocher du relevé individuel d'activité fourni par la caisse. Les remplaçants et les titulaires qui rétrocèdent des honoraires ont un second piège : la rétrocession versée au-delà de 2 400 € par bénéficiaire et par an se déclare sur la DAS2. Nos pages infirmier libéral, kinésithérapeute, ostéopathe, psychologue et médecin détaillent les spécificités de chaque métier.

TVA : vérifiez d'abord si vous êtes concerné

La plupart des professions de santé réglementées sont exonérées de TVA sur leurs soins (article 261, 4, 1° du CGI). Un module TVA ne leur sert alors à rien. À l'inverse, un avocat, un consultant ou un architecte qui dépasse la franchise en base doit déclarer sa TVA, et le logiciel doit gérer la TVA sur les encaissements propre aux prestations de services. Dans les deux cas, la réforme de la facturation électronique s'applique aux assujettis, y compris ceux qui ne facturent pas de TVA : notre guide facturation électronique sans TVA fait le point.

3. Le comparatif des logiciels de comptabilité pour libéraux

Le tableau ci-dessous reprend les tarifs relevés sur les pages officielles le 22 octobre 2026, hors promotions temporaires. Le prix annuel d'entrée est celui de la première formule qui inclut la 2035, pas celui de la formule gratuite. "Non annoncé" signifie que la page officielle ne mentionne pas la fonction : elle peut exister, mais nous ne l'avons pas vue écrite.

Indy couvre l'entreprise individuelle en BNC au réel, mais pas l'EI au réel en BIC : pour les artisans et commerçants en entreprise individuelle, Indy s'arrête au micro-BIC. Ce point ne gêne pas un libéral, sauf s'il exerce une activité commerciale accessoire dans la même entreprise.

4. Solution par solution

Indy : la 2035 de bout en bout pour 264 € HT par an

Indy est un logiciel de comptabilité, pas un cabinet d'expertise comptable. Sa grille pour l'entreprise individuelle compte quatre paliers. Essentiel (0 €) et Plus (9 € HT/mois en annuel) servent à tenir la comptabilité et à facturer, mais ne font aucune déclaration. La 2035 commence avec Autonomie : 22 € HT/mois en paiement annuel, soit 264 € HT par an, ou 28 € HT/mois sans engagement. Cette formule génère la 2035 et la télétransmet, et prépare la TVA, la DSFU, la CFE, la DAS2 et la 2042-C-PRO. Les questions passent par chat et par mail, sans limite de nombre. Indy annonce aussi une garantie fiscale sur cette formule.

Pour ceux qui veulent un regard humain sur leurs comptes, Sérénité (71 € HT/mois en annuel, 87 € sans engagement) ajoute un expert-comptable partenaire qui gère vos déclarations et trois heures de rendez-vous par an. Le compte pro et la facturation électronique sont gratuits, et le premier mois est offert en passant par notre lien. Indy figure parmi les plateformes agréées pour la facturation électronique. Notre avis complet sur Indy détaille l'application, et les duels Indy vs Tiime, Pennylane vs Indy et Indy vs Abby comparent les formules point par point.

MaCompta.fr : la comptabilité classique en modules

MaCompta.fr vend sa comptabilité en briques. Pour un libéral, il faut la comptabilité Complète (15,40 € HT/mois en annuel, que l'éditeur destine aux professions libérales), le module Déclarations fiscales (8,75 € HT/mois en annuel, avec télétransmission EDI et prise en charge des BNC) et, si vous avez du matériel à amortir, le module Immobilisations (2,64 € HT/mois en annuel). Total : 24,15 € HT/mois sans immobilisations, 26,79 € avec, soit 289,80 à 321,48 € HT par an. En mensuel, comptez 30,44 € HT/mois pour les trois modules. Le guide utilisateur pour professions libérales publié par l'éditeur décrit l'édition et l'envoi de la 2035 et des tableaux destinés aux organismes de gestion. C'est un outil de comptable : vous saisissez en partie double, ce qui convient à qui connaît déjà la logique comptable. La page tarifs ne mentionne ni la DSFU ni la DAS2.

Pennylane : puissant, mais pensé pour les sociétés

Pennylane propose quatre formules pour les indépendants : Starter 7 €, Basique 14 €, Essentiel 24 € et Premium 79 € HT/mois. Seule Premium inclut le module comptable et la "gestion des déclarations fiscales en EDI (TVA, liasse fiscale...)". La page ne cite pas la 2035 nommément, et Pennylane rappelle qu'il n'est pas un cabinet d'expertise comptable. À 948 € HT par an, il coûte plus cher qu'un expert-comptable en ligne spécialisé dans les libéraux : il se justifie surtout si vous l'utilisez déjà avec votre cabinet. Voir notre avis sur Pennylane.

Tiime : la pré-comptabilité reliée à un cabinet

Tiime (gratuit, puis 9,99 €, 17,99 € et 24,99 € HT/mois facturés annuellement) gère la facturation, les justificatifs, les notes de frais et un compte pro. Il ne produit pas la 2035 seul : il structure vos données et les partage avec un expert-comptable, que Tiime recommande vivement de choisir parmi ses cabinets partenaires. C'est un bon outil du quotidien si vous avez déjà un cabinet, pas un logiciel 2035 autonome. Notre avis sur Tiime détaille les formules.

Abby : excellent en micro, hors sujet au réel

Abby (Basique gratuit, Start 9 €, Pro 15 €, Business 33 € HT/mois) est un très bon outil de facturation et de suivi pour micro-entrepreneur. Sa formule Business mentionne une "déclaration d'impôts", mais la page tarifs ne parle ni de 2035, ni de régime réel, ni de télétransmission. Pour un libéral au réel, il ne remplace pas un logiciel 2035. Voir notre avis sur Abby.

Les logiciels installés et les outils métiers

Des éditeurs historiques ont vendu des logiciels "comptabilité libérale" à installer sur un poste, comme EBP Comptabilité Libérale. Leur tarif n'est pas public sur une page de prix et passe souvent par un revendeur : demandez un devis et vérifiez que la version achetée produit bien la 2035 de l'année et inclut la télétransmission. Certains outils autrefois cités dans les comparatifs ont changé de positionnement : le site de Comptalib annonce que l'application devient TeamSystem Facture, une offre centrée sur la facturation dont la page d'accueil ne mentionne pas la 2035.

5. Quel logiciel selon votre profil

Pour choisir, répondez à quatre questions : êtes-vous au réel, êtes-vous assujetti à la TVA, versez-vous des rétrocessions, et voulez-vous qu'un professionnel engage sa responsabilité sur vos comptes ?

6. Logiciel comptable gratuit pour profession libérale : ce qui l'est vraiment

Plusieurs formules à 0 € existent, mais aucune de celles que nous avons vérifiées ne s'occupe de la 2035.

Au réel, ce qu'une offre gratuite ne fait pas, c'est la télétransmission. La 2035 doit partir par voie électronique, et la grande majorité des libéraux passe par un logiciel ou un cabinet partenaire EDI. La seule voie sans abonnement est la saisie en ligne dans votre espace professionnel sur impots.gouv.fr (mode EFI), quand elle est ouverte pour votre déclaration : vérifiez-le dans votre espace avant de compter dessus, car les éditeurs ne s'accordent pas sur sa disponibilité pour la 2035. Même dans ce cas, vous remplissez chaque case à la main à partir de votre tableur, sans contrôle de cohérence, et personne ne vérifiera que vos amortissements ou votre quote-part de véhicule tiennent en cas de contrôle. Pour 22 € HT par mois, Indy Autonomie fait la saisie à partir de la banque, les contrôles et l'envoi.

Les essais gratuits restent utiles pour choisir : un mois chez MaCompta.fr, quinze jours chez Pennylane, et le premier mois d'Indy offert via notre lien. Testez-les sur un vrai mois de relevés bancaires, pas sur des données de démonstration. Pour aller plus loin sur les outils sans abonnement, voir notre sélection de logiciels de comptabilité gratuits.

7. Logiciel ou expert-comptable ?

Un logiciel 2035 suppose que vous restiez responsable de vos chiffres. Le logiciel automatise la saisie et remplit les cases, mais il ne signe pas votre déclaration et ne vous représente pas en cas de contrôle. Indy, comme Pennylane, n'est pas inscrit à l'Ordre des experts-comptables. Ce n'est pas un problème pour un libéral dont l'activité tient en une page de relevés par mois, mais cela le devient avec une SCM, des salariés ou une cession de patientèle.

Comparé à un cabinet, l'écart de prix est net : 264 € HT par an pour Indy Autonomie contre 468 € HT pour l'offre libéraux de L-Expert-Comptable.com et 588 € HT pour le pack Essentiel de Dougs. Le cabinet en ligne fait le travail à votre place et répond de sa qualité. Notre duel Indy vs expert-comptable chiffre les deux options sur plusieurs profils, et notre classement des meilleurs experts-comptables pour professions libérales compare les cabinets spécialisés BNC. Pour les obligations comptables elles-mêmes, voir notre guide de la comptabilité d'une profession libérale.

8. Le calendrier que votre logiciel doit tenir

Un libéral au réel a plusieurs échéances par an. Un bon logiciel vous les rappelle et prépare chacune à partir des mêmes données bancaires, ce qui évite les incohérences entre la 2035 et la DSFU.

Les dates exactes sont fixées chaque année par l'administration. Un retard sur la 2035 entraîne une majoration de 10 % de l'impôt dû, portée à 40 % après une mise en demeure restée sans réponse pendant 30 jours. Si vous démarrez au réel en cours d'année, choisissez votre outil dès le premier mois : reconstituer douze mois de livre-journal en avril prend plus de temps que de le tenir au fil de l'eau.

Questions fréquentes